Mit der Eröffnung des Navi Mumbai International Airport haben zwei große indische Fluggesellschaften ihren Betrieb dort aufgenommen. Air India Express gehört zu den ersten Airlines, die am Eröffnungstag Linienflüge anboten. Zunächst starteten Direktverbindungen nach Bengaluru und Delhi. Ab dem 25. Dezember 2025 fliegt die Airline täglich nach Bengaluru sowie an fünf Tagen pro Woche nach Delhi, ab Januar 2026 wird das Angebot weiter ausgebaut. Navi Mumbai ist Teil der sogenannten Dual-Airport-Strategie für den Großraum Mumbai.
Auch Indigo hat den neuen Flughafen unmittelbar in ihr Netzwerk integriert. Zum Start verbindet die größte Airline des Landes Navi Mumbai mit dreizehn Zielen innerhalb Indiens, darunter Delhi, Bengaluru, Hyderabad, Chennai und Ahmedabad. Die meisten Strecken werden täglich bedient, weitere folgen bis Ende Dezember. Mit dem zweiten Flughafen will IndiGo zusätzliche Kapazitäten schaffen und den stark ausgelasteten bisherigen Flughafen von Mumbai entlasten.
